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胆囊癌对各种化疗药物均无不敏感，很难观察其疗效，但近年来随着化疗药物不断开发临床大量研究，对于根治术后化疗和不能手术者，或术后复发的患者，化疗都有一定的疗效。
适应证：①不宜手术或放疗和各期病人;②晚期及广泛转移，骨髓、肝肺、心、肾功能正常者;③手术或放疗后巩固治疗，或手术、放疗后复发或转移的患者。
1.联合化疗
(1)FAM方案：
5-FU 600mg/m2，静脉滴注，第1、8、29、36天;
ADM 30mg/m2，静脉注射，第1、29天;
MMC 6mg/m2，静脉注射，第10天。
6周一疗程，休息4～6周，行第2疗程。25%有效，平均生存期8.4个月。
(2)FAB方案
5-FU 400～600mg/m2，第1、22天，200～400mg/m2，第4、26天，静脉滴注;
ADM 60mg/m2，第1天，45mg/m2，第22天，静脉注射;
卡莫司汀 150mg/m2，静脉注射。
4周为一疗程。治疗有效率40%左右，平均生存11个月。
(3)FM方案
5-FU 500mg/m2，静脉滴注，第1～3天;
MMC 6mg/m2，静脉注射，第1～3天。
用药3天为一周期，休息4～5周可重复一次，4～6个周期为一疗程。
2.单药化疗
卡莫司汀(BCNU)：125mg/次.d,静脉点滴,连用3次为一疗程,间隔6～8周可行第二疗程.主要毒性为骨髓抑制,多在用药8～10天时出现白细胞和血小板下降,用药后6周达最低值;其次为消化道反应，出现恶心、呕吐，少数病人出现肝功能损害、谷丙转氨酶升高等。
优福定(UFT)：口服，每次4片，每天3次，4～8周为一疗程，疗效较替加氟(FT-207)稍高，毒副作用同5-FU，但较轻。
替加氟(FT-207)：本品为氟尿嘧啶的衍生物，在体主要经肝脏转移变为氟尿嘧啶而起作用，其作用与氟尿嘧啶相同，化疗指数为氟尿嘧啶的2倍，而毒性仅为其1/5～1/6。本品口服吸收良好，持续时间为12～20小时，可均匀地分布于肝、肾、小肠、脾和脑。用法：200～400mg/次，口服，每天3次，20～40g为一疗程。
禁忌症：
1.全身情况很差伴有恶病质者;
2.有严重肝、肾、心、肺功能障碍者;
3.白细胞减少至4×109/L，血小板小于50×109/L，有出血倾向者;
4.有其他严重并发症，如严重感染、胆囊穿孔、消化道出血等。
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