细菌与病毒性呼吸道感染的临床症状比较相似，但药物的治疗却有所不同。因此，正确地鉴别对合理用药极为重要。下面从六个方面介绍细菌与病毒性呼吸道感染的鉴别。
一、流行性病毒性呼吸道感染具有明显的群体发病的特点，短期内有多数人发病，或一家人中有数人发病；而细菌性呼吸道感染则以散发性多见，患者身旁少有或没有同时上呼吸道感染的病人。
二、病毒性上呼吸道感染，一般鼻腔流涕症状比咽部症状明显；而细菌性上呼吸道感染则扁桃体或咽部红肿及疼痛比较明显。若伴有腹泻或眼结膜充血，则倾向是病毒感染。
三、单纯病毒性呼吸道感染多无脓性分泌物，而脓痰是细菌性感染的重要证据。
四、病毒性感染起病急骤，全身中毒症状可轻可重；而细菌感染起病可急可缓，全身中毒症状相对较重。如果开始发热不高，2~3天后病毒加重，则多为细菌性感染。
五、白细胞计数，一般由病毒感染者白细胞总数偏低或正常，早期中性粒细胞百分数可稍高；而细菌感染时，白细胞总数和中性粒细胞百分数均见增高。因此，如果临床不做血象检查，就难以确定病原体是病毒还是细菌。
六、对有发热症状的上呼吸道感染者，可给予退热药物，如安乃近、复方安基比林等治疗。病毒性感染能取得暂时而明显的退热效果，全身症状亦有所改善。但细菌性感染者服用同样剂量的退热药，退热效果较差，全身症状无明显改善。
