主要的治疗措施有：
１．抗幽门螺杆菌治疗。幽门螺杆菌是萎缩性胃炎的致病菌。因此治疗萎缩性胃炎首先应进行抗菌治疗。具体方法是在胶体铋剂（果胶铋、奥美拉唑、枸橼酸铋等）中选择1种，加上克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑3种抗菌素中的2种，同时服用。
２．服用胃粘膜保护剂。具有保护胃粘膜的常用药物有硫糖铝、胃膜素、叶绿素等。硫糖铝能与胃粘膜的粘蛋白形成保护膜，起到保护胃粘膜的作用；胃膜素能在胃内形成膜状物覆盖在胃粘膜上，以减少胆汁反流对胃粘膜的刺激；叶绿素有促进胃粘膜炎症愈合的作用。
３．提高胃酸浓度治疗。萎缩性胃炎病人的胃内常呈缺酸状态。因此病人可服用胃蛋白酶合剂或稀盐酸合剂治疗。
４．服维酶素治疗。维酶素具有提高人体免疫力，抑制癌细胞生长的作用。因此，萎缩性胃炎病人可选用维酶素治疗。
５．控制胆汁反流治疗。胆汁反流是萎缩性胃炎形成的一个常见原因。为了控制胆汁反流，病人可服用吗丁啉（多潘力酮）、普瑞博思（西沙必利）及胃复安等药物治疗。
６．饮食疗法。萎缩性胃炎病人应避免饮用浓茶、烈酒、咖啡等刺激性食物，在进食时应注意细嚼慢咽，忌暴饮暴食。胃酸过低和有胆汁反流的萎缩性胃炎病人，宜多吃瘦肉、禽肉、鱼、奶类等蛋白含量较高而脂肪含量较低的食物。
７．消除某些致病诱因。萎缩性胃炎病人为了防止病情加重，应戒烟，戒酒，并避免长期服用对胃粘膜有刺激的药物（水杨酸钠、消炎痛、保泰松和阿司匹林等）。另外，萎缩性胃炎病人还应保持乐观的情绪，以增强机体的抗病能力。
８．定期复查。为了监视病变的动态变化，萎缩性胃炎病人应定期复查胃镜。一般性萎缩性胃炎病人（病理上无肠上皮化生和不典型增生者）应每3年检查１次；不完全性结肠型肠上皮化生伴轻度不典型增生者（癌变率为2.5％）应每年检查1次；伴中度不典型增生者（癌变率为4％—8％）应每3个月检查１次；伴重度不典型增生者（癌变率10％以上）应视为癌前病变，可予手术切除。
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