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胃肠道功能紊乱不是器质性的病理改变，也不是某种一般的单纯性功能性病理变化，而是一种以心理因素为背景及胃肠道功能失调为主要表现的临床慢性常见病。必须强调指出，在诊断此症前必须排除器质性疾病，尤其是胃肠道的恶性病变。 应根据不同情况采取X线、内镜检查、胃液分析与粪便化验等手段，必要时应做超声、CT等检查以排除肝、胆、胰等腹腔脏器病变。
胃肠道功能紊乱治疗重不在药物，而在于平常的饮食生活。只有通过精神调适和改变行为等方式，才能从根本上调整胃肠道功能紊乱。传统治疗上应用饮食疗法、营养支持疗法、镇静安眠、缓痉止痛综合治疗为主，医生可根据病情对症使用谷维素、消化酶、维生素B1、胃达喜、吗叮啉等治疗。对具有明显精神症状的患者，给予抗焦虑或抗抑郁药，解除心理障碍。重要的是采用心理治疗，其方法一般是解释、安慰、疏导、分析、认识、积极暗示和情绪转移，让患者真正认识病情、主动调节情绪、消除思想顾虑，提高疾病治愈信心。
对于成年女性、脑力劳动者、性格内向者、常处于神经过敏状态的人等胃肠道功能紊乱易感人群，从以下四方面去预防此病，显得尤为重要。
首先要重视心理卫生，解除心理障碍，调整脏器功能；其次注意饮食卫生，吃饭时一定要细嚼慢咽，使食物在口腔内得到充分的磨切，并与唾液混合，减轻胃的负担，使食物更易于消化，尽量少吃刺激性食品，更不能饮酒和吸烟；第三是适当参加体育锻炼，参与娱乐活动，学会幽默可以减少心理上的挫折感，求得内心的安宁，增加愉快生活的体验；第四是生活起居应有规律，少熬夜，不过分消耗体力、精力，主动适应社会及周围环境，注意季节气候变化及人际关系等因素对机体的不良影响，避免胃肠道功能紊乱的发生或发展。
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