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9月20日15时，哈尔滨市疾病预防控制中心通知哈尔滨工程大学，确诊了该校两例轻度甲型H1N1流感病例。
两例轻度甲型H1N1流感病例分别是哈工程大学理学院2009级学生和后勤集团公寓管理员，二人于9月18日因发烧分别自行到医院就诊。
9月20日，哈尔滨市疾病预防控制中心通知哈工程大学，2人被确诊为轻度甲型H1N1流感病例。
目前，2人体温已恢复正常，基本痊愈。目前，学校已及时采取防控措施，全面排查密切接触人员，对以上2人同寝、同班的60多名密切接触者已经停课，并采取了相应隔离观察措施。
目前隔离观察人员尚未出现感染症状。
为有效预防甲型H1N1流感，做好甲型H1N1流感的防控隔离工作，9月21日，哈工程大学将学生第一公寓设为医疗观察备用，现有学生已在后勤集团协助下陆续搬离一公寓。学校有关部门已及时妥善做好第一公寓学生的寝室调换工作，做好隔离设备、生活用品的准备工作，并为搬家的学生每人发放了100元的搬家补助。
与此同时，根据甲型H1N1流感防控工作形势，哈工程大学正式启动甲型H1N1流感防控二级预警预案，成立甲型H1N1流感防控指挥部。
指挥部下设综合协调组、医疗组、后勤保障组、宣传组、学生教育组、家属区工作组、警戒保卫组、医疗观察工作组等8个小组。
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