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5月19日，在日本首都东京，一些刚到东京的外地中学生带着口罩走在街头。据日本厚生劳动省报告，截至当日16时30分，日本全国确诊甲型H1N1流感病例达178例，其中非输入性甲型H1N1流感确诊病例174例。
日本东京都20日宣布，居住在都内八王子市的一名高中女生被确诊感染甲型H1N1流感，随后这名女生的一名女同学也被确诊感染。
这两名16岁的女学生就读于毗邻东京的神奈川县川崎市的私立洗足学园高中。 第二名女生即在川崎市被确诊。她们曾于本月11日至18日在美国纽约逗留，同行的还有该校数名学生和教师。八王子市的女生从美国乘飞机回到日本的时候已经出现发热症状，但是在机舱内的简易检测结果是呈甲型H1N1流感阴性反应。因此，有关部门没有对其采取隔离措施。
自治医科大学附属医院感染控制部部长森泽雄司说，东京都确诊了甲型H1N1流感，使流感在首都地区的扩散已不可避免。地方政府有必要主动采取措施，完善以医院为中心的医疗体系，应避免人们因反应过度涌到医疗机构，影响医疗机构处理其他紧急疾病。
东京都为防范高致病性流感，储备了400万人份的抗流感药物达菲和乐瑞沙，并从4月末至5月20日在都内设置了65处发热门诊部。另外，东京都18日规定，都内的医院和学校如果有超过3人在简易检测中呈阳性反应，则不管有无出国经历或与确诊患者接触的可能性，都要接受聚合酶链式反应（PCR）检测。
截至当地时间20日23时（北京时间22时），日本共确诊甲型H1N1流感患者267名。
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