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彻底消灭、清除体内的乙肝病毒，是治疗乙肝的根本目的。检验这一目的是否达标的途径有两条：一是通过血液化验；一是通过肝组织学检查。血液检查只需对患者进行抽血化验即可；而肝组织学检查则需进行肝脏穿刺。反复地对病人进行肝脏穿刺，取活组织检查，在理论上是可行的，而在实际临床工作中却寸步难行。一个患者偶而接受一次肝脏穿刺尚可，而多次反复地进行肝脏穿刺是根本不可能的。
通过血液化验可检查乙肝病毒表面抗原、ｅ抗原、ｅ抗体、核心抗体及乙肝病毒脱氧核糖核酸等项目。人们常说的“转阴治疗”，也就是让这些病毒指标转阴。最常见的是“大三阳”（表面抗原、ｅ抗原及核心抗体阳性）转为“小三阳”（表面抗原、ｅ抗体及核心抗体阳性）或是“小二阳”?即表面抗原和核心抗体阳性 。过去认为这些指标转阴了，病情也就自然好转了。但现在看来，这种观点是错误的。研究发现，人体血液中的乙肝病毒变化形式是极其复杂的。那么，该如何判断、分析乙肝病毒指标阴转究竟是好还是不好呢？
如果病人随着乙肝病毒指标的阴转，伴有食欲不振、疲乏、肝区不适、腹胀等症状减轻，肝功能恢复正常，乙肝病毒主要的复制指标?ｅ抗原、乙肝病毒脱氧核糖核酸 持续阴性，则表明病情好转。如果病人在病毒指标转阴的同时伴有疲乏劳累、腹胀、纳差、面色萎黄、肝掌、蜘蛛痣等病症，且转氨酶、黄疸反复升高，白蛋白下降明显，球蛋白上升等，则揭示病情加重。如果遇到这种情况，说明病毒指标是由病毒变异造成的。病毒变异的形式是多种多样的，变异的后果也是相当复杂的。病毒变异本身说明病毒是一种适应性极强的生物体，它并非那么容易被消灭。目前，尚无绝对有效的抗乙肝病毒药物。因此，乙肝病毒转阴未必是好事。乙肝病人在治疗过程中大可不必一味要求病毒指标阴转，而应首先强调肝功能的长期正常及稳定。
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