阴道当然也不例外。阴道经上端与子宫、输卵管相连直通腹腔，下端则与外界直接相通；它的开口处前方是尿道口，后方是肛门，很容易遭受污染。其中，既有常驻的各种微生物（包括细菌、病毒和支原体等），又可因性接触，而临时带入多种病原体。
过去，有人对280名孕妇进行研究，从阴道内共查出19种（属）微生物，如棒状杆菌、乳酸杆菌、表皮葡萄球菌等常驻菌，甚至还有被认为是致病性强的大肠杆菌或金黄色葡萄球菌等（由于检验技术的进步，现今发现的更多）。但是，为什么有些不太讲究个人卫生的妇女不发病，而那些十分讲究个人卫生的妇女，有时却会发生严重的外阴、阴道或盆腔炎症，而且还久治不愈呢？这就和生态平衡与否有关了。
原来，妇女的生殖器官，在解刮和生理上都有其独特的防御结构和功能。妇女外阴两侧的小阴唇经常合拢关闭，阴道前后壁又紧贴在一起，形成了自然的防御屏障，更重要的是阴道上皮细胞，在雌激素影响下，能够发生周期性变化并脱落，由于含有不同程度的糖原，在阴道杆菌的作用下，将糖原转化成乳酸，使阴道酸碱度保持在ph4～4.5之间，这样，适应在碱性环境中生存的微生物，便不能在此生长繁殖。这种自然产生的防御功能，也叫做“自净作用”。
生态平衡时，阴道内的菌群是有一定组合结构的。例如：有多少种（属）的微生物，它们的比例各占多少，生存在阴道的哪一部位等，都受着生态因素的严密控制。通过这种控制，不仅常驻的正常菌群不外流，而且也使外来的微生物难于定居下去。
当妇女患有贫血、营养不良、高热、过度虚弱或疲劳时，由于抵抗力降低，微生物之间的正常生理组合便会发生变化，以致细菌比例失调而产生致病性。通常情况下，在一些健康带菌者中，虽然可以检出携带真正的致病菌，如伤寒杆菌或痢疾杆菌等，但并不发玻，可是，如生态平衡失调，则会导致菌群失调，进而发玻 .
在大量应用抗生素的今天，某一种抗生素能够很容易消灭对其敏感的病原体，但是亦可发生菌群的比例失调，此时其他病原体即可乘机发作。例如霉菌性阴道炎、葡萄球菌性阴道炎、绿脓杆菌性阴道炎等，多半是滥用抗生素的结果。因此，在治疗阴道炎时，一方面要杀灭某种致病的病原体，另方面更要着眼于调整菌群，使其恢复正常的生态平衡。日常生活中，一旦发现白带增多，或感觉不正常，如阴道坠胀、灼热或瘙痒，应积极检查并进行治疗。其防治方法有：1.锻炼身体，提高抗病能力特别是患有月经失调疾病时，则应积极治疗，以免因内分泌平衡失调而引起阴道的菌群失调。2.切勿滥用药物如抗生素、激素、细胞毒类药物、免疫抑制剂或同位素等，以免使正常微生物群和人体内的生态平衡遭受严重破坏。3.忌用碱性溶液，如硬肥皂水等冲洗阴道，应保持阴道的酸性环境，以利于正常菌群的生存。4.避免不洁性生活，以免带来意外的病原体感染。5.如发现患有阴道炎时，则应分清是哪一种病原体感染，根据不同情况，除进行局部治疗外，还应重视全身状态的改善和提高免疫功能。同时应注意对性对象的治疗。6.局部治疗时，应将药物放入阴道后穹窿深处（多数病原体在该处生长繁殖），方可奏效。
