近年来，在尿路结石症的治疗上有了突破性进展,但在小儿远不及成人。对于成人，很多过去必须手术取出的肾结石，现在可以通过体外冲击波碎石，经皮肾镜、输尿管肾盂镜取石和溶石的方解决,从而避免了手术。但是，对于小孩，很多手术都要做好全面的评估才能进行，而且专家建议能避免手术的尽量避免。小儿肾结石主要的治疗方法有以下几种：
1.一般治疗
(1)对于肾绞痛，可进行暂时性的指压止痛：用拇指压向患侧骶棘肌外缘、第三腰椎横突处，可收到止痛或缓解疼痛的效果。
(2)大量饮水：大量饮用开水或磁化水，不仅增加尿量起到冲洗尿路、促进结石向下移动的作用，而且还可稀释尿液减少晶体沉淀。
(3)经常作跳跃活动，或对肾下盏内结石行倒立体位及拍击活动，也有利于结石的排出。
(4)其它：对尿培养有细菌感染者，选用敏感染物积极抗感染，对体内存在代谢紊乱者，应积极治疗原发疾病以及调理尿的酸碱度等等。
2.药物治疗
(1) 解痉止痛：常用药物为杜冷丁及阿托品，用阿托品0.5毫克及杜冷丁50～100毫克肌肉注射，口服颠茄片16毫克，一天三次。
(2) 中草药治疗：常用药物有金钱草、海金沙、瞿麦、扁畜、车前子、木通、滑石、鸡内金、石苇等可随症加减。
(3)控制感染：常根据尿培养选择合适的抗生素，提倡足量足疗程治疗。
(4)对症处理：调节水电解质、酸碱平衡紊乱
3.手术治疗 近年来，在尿路结石症的治疗上有了突破性进展在小儿远不及成人。对于成人，很多过去必须手术取出的肾结石，现在可以通过体外冲击波碎石，经皮肾镜、输尿管肾盂镜取石和溶石的方解决。而避免手术。但是，对于小孩，很多手术都要做好全面的评估才能进行。
(1)开放性手术取石：适于结石较大，直径大于0.8厘米(年幼儿大于0.4厘米)，或结石多角、粗糙，估计不能从尿道排除者，或结石已经引起了梗阻症状者，经常发生绞痛及大量血尿的结石，原则上都应去除。但由于小儿生理结构的原因，开放性手术用于小儿在仪器和技术上都受到了一定的限制，但由于小儿泌尿系结石常伴有解剖畸形，需要在手术中进行一并处理，因此开放性手术至今仍是取石的主要方法。去除肾结石的主要开放性手术是肾盂切开或肾窦切开取石，局限于肾一极的多发性结石或肾一极的肾盂积液感染结石，可考虑做肾脏部分切除;较大的鹿角形结石分支嵌顿于肾盂肾盏内，可考虑部分肾切除或原位控制低温下行肾切开取石，或离体肾脏手术。
(2)经腹腔镜取石 这是新近开展的微创手术，应用小儿腹腔镜，切开肾盂，钳出结石，具有微创小，恢复快的优点。
(3)体外震波碎石(ESWL) 但小儿体表小，组织器官娇嫩，震波冲击的同时，肾脏周围的脏器都会受到震波的冲击，使得肾内产生实质性瘢痕、肺出血、胸壁损伤等并发症。另外，较大的胱氨酸结石对ESWL不起反应，难以震碎。而且，小儿肾盂输尿管连接部位梗阻并发的结石，梗阻不解决，碎石根本就无法排出。
(4)经皮肾碎石术 仪器和技术不够成熟，使得其应用受到了一定的限制，比较少用。
